MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009484	GTG	2	6	243150	243155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259230
6002	NC_009484	GC	3	6	243168	243173	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6003	NC_009484	CGG	2	6	243209	243214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6004	NC_009484	GCG	4	12	243221	243232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6005	NC_009484	CGA	2	6	243269	243274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259230
6006	NC_009484	GGT	2	6	243332	243337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259230
6007	NC_009484	CCGG	2	8	243348	243355	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6008	NC_009484	GCG	2	6	243368	243373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6009	NC_009484	CGG	2	6	243382	243387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6010	NC_009484	GGT	2	6	243389	243394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259230
6011	NC_009484	GC	3	6	243491	243496	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6012	NC_009484	CGT	3	9	243512	243520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259230
6013	NC_009484	CGG	2	6	243544	243549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259230
6014	NC_009484	GC	3	6	243554	243559	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6015	NC_009484	CGGC	3	12	243584	243595	0 %	0 %	50 %	50 %	148259230
6016	NC_009484	CGC	2	6	243635	243640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259230
6017	NC_009484	CGG	2	6	243655	243660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6018	NC_009484	GCC	2	6	243674	243679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6019	NC_009484	CGCTG	2	10	243712	243721	0 %	20 %	40 %	40 %	148259231
6020	NC_009484	TGCG	2	8	243740	243747	0 %	25 %	50 %	25 %	148259231
6021	NC_009484	CCG	2	6	243754	243759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6022	NC_009484	CGG	2	6	243771	243776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6023	NC_009484	GAT	2	6	243791	243796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259231
6024	NC_009484	GTG	2	6	243801	243806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259231
6025	NC_009484	CGG	2	6	243818	243823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6026	NC_009484	GGGCCG	2	12	243855	243866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6027	NC_009484	GCGGT	2	10	243954	243963	0 %	20 %	60 %	20 %	148259231
6028	NC_009484	GCG	2	6	243978	243983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6029	NC_009484	CG	3	6	243982	243987	0 %	0 %	50 %	50 %	148259231
6030	NC_009484	GCC	2	6	244017	244022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6031	NC_009484	GCA	2	6	244033	244038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259231
6032	NC_009484	CGGGG	2	10	244118	244127	0 %	0 %	80 %	20 %	148259231
6033	NC_009484	TTG	2	6	244143	244148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259231
6034	NC_009484	CGC	2	6	244168	244173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6035	NC_009484	GGC	2	6	244190	244195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259231
6036	NC_009484	CGC	2	6	244202	244207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6037	NC_009484	CGA	2	6	244225	244230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259231
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6039	NC_009484	CTC	2	6	244271	244276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259231
6040	NC_009484	GC	3	6	244283	244288	0 %	0 %	50 %	50 %	148259231
6041	NC_009484	CGC	2	6	244295	244300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259231
6042	NC_009484	CCCG	2	8	244316	244323	0 %	0 %	25 %	75 %	148259231
6043	NC_009484	GGC	2	6	244453	244458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259232
6044	NC_009484	GCA	2	6	244473	244478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6045	NC_009484	GCC	2	6	244492	244497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
6046	NC_009484	GTA	2	6	244504	244509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259232
6047	NC_009484	TCG	2	6	244517	244522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259232
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6049	NC_009484	GTCG	2	8	244555	244562	0 %	25 %	50 %	25 %	148259232
6050	NC_009484	GCG	2	6	244573	244578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259232
6051	NC_009484	CGA	2	6	244623	244628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6052	NC_009484	TCGTC	2	10	244635	244644	0 %	40 %	20 %	40 %	148259232
6053	NC_009484	GCA	2	6	244695	244700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6054	NC_009484	AGC	2	6	244769	244774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6055	NC_009484	CGC	2	6	244786	244791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
6056	NC_009484	CG	3	6	244797	244802	0 %	0 %	50 %	50 %	148259232
6057	NC_009484	CGGC	2	8	244823	244830	0 %	0 %	50 %	50 %	148259232
6058	NC_009484	ACC	2	6	244835	244840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259232
6059	NC_009484	CTT	2	6	244855	244860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259232
6060	NC_009484	CGC	2	6	244870	244875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
6061	NC_009484	GCT	2	6	244890	244895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6062	NC_009484	GCC	2	6	244921	244926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
6063	NC_009484	TGCGGA	2	12	244950	244961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259232
6064	NC_009484	CAT	2	6	244981	244986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259232
6065	NC_009484	CTG	2	6	245032	245037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259232
6066	NC_009484	GCCG	2	8	245062	245069	0 %	0 %	50 %	50 %	148259232
6067	NC_009484	CGT	2	6	245071	245076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259232
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6069	NC_009484	CCGG	2	8	245090	245097	0 %	0 %	50 %	50 %	148259232
6070	NC_009484	GGT	2	6	245110	245115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259232
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6072	NC_009484	CGC	2	6	245350	245355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259232
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6094	NC_009484	CG	3	6	246229	246234	0 %	0 %	50 %	50 %	148259232
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6102	NC_009484	TGG	2	6	246587	246592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259232
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6104	NC_009484	GAC	2	6	246613	246618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259232
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6108	NC_009484	GAA	2	6	246807	246812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259232
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6116	NC_009484	CGGGG	2	10	247330	247339	0 %	0 %	80 %	20 %	148259233
6117	NC_009484	GCTGGT	2	12	247341	247352	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148259233
6118	NC_009484	CGGGG	2	10	247362	247371	0 %	0 %	80 %	20 %	148259233
6119	NC_009484	CGC	2	6	247406	247411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259233
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6121	NC_009484	CGA	2	6	247452	247457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259233
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6237	NC_009484	AGAA	2	8	251553	251560	75 %	0 %	25 %	0 %	148259237
6238	NC_009484	GCA	2	6	251573	251578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259237
6239	NC_009484	GCC	2	6	251589	251594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259237
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6242	NC_009484	GTC	2	6	251737	251742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259238
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6245	NC_009484	GGC	2	6	251833	251838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259238
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6274	NC_009484	GCC	2	6	252712	252717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259238
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6350	NC_009484	TCA	2	6	255963	255968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259241
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6354	NC_009484	ACA	2	6	256167	256172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259241
6355	NC_009484	ACCA	2	8	256175	256182	50 %	0 %	0 %	50 %	148259241
6356	NC_009484	CCCGG	2	10	256266	256275	0 %	0 %	40 %	60 %	148259241
6357	NC_009484	CGG	2	6	256284	256289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259241
6358	NC_009484	GTGG	2	8	256297	256304	0 %	25 %	75 %	0 %	148259241
6359	NC_009484	CGG	2	6	256315	256320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259241
6360	NC_009484	TCG	2	6	256332	256337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259241
6361	NC_009484	ATT	2	6	256383	256388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148259241
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6363	NC_009484	GAA	2	6	256441	256446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259241
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6479	NC_009484	CAT	2	6	260607	260612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6480	NC_009484	CGAC	2	8	260660	260667	25 %	0 %	25 %	50 %	148259245
6481	NC_009484	GCC	2	6	260671	260676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259245
6482	NC_009484	GGCG	2	8	260682	260689	0 %	0 %	75 %	25 %	148259245
6483	NC_009484	GC	3	6	260787	260792	0 %	0 %	50 %	50 %	148259245
6484	NC_009484	CGCCA	2	10	260875	260884	20 %	0 %	20 %	60 %	148259245
6485	NC_009484	GGC	2	6	260886	260891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
6486	NC_009484	CAT	2	6	260901	260906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259245
6487	NC_009484	CAA	2	6	260916	260921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259245
6488	NC_009484	CCGG	2	8	260928	260935	0 %	0 %	50 %	50 %	148259245
6489	NC_009484	TTG	2	6	260965	260970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148259245
6490	NC_009484	GCG	2	6	260999	261004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
6491	NC_009484	AGG	2	6	261059	261064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259245
6492	NC_009484	CTG	2	6	261070	261075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6493	NC_009484	CGG	2	6	261116	261121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
6494	NC_009484	TCGAG	2	10	261134	261143	20 %	20 %	40 %	20 %	148259245
6495	NC_009484	TCG	2	6	261212	261217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6496	NC_009484	GC	3	6	261243	261248	0 %	0 %	50 %	50 %	148259245
6497	NC_009484	CGA	2	6	261255	261260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6498	NC_009484	GTC	2	6	261352	261357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259245
6499	NC_009484	CGG	4	12	261419	261430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259245
6500	NC_009484	GAAG	2	8	261489	261496	50 %	0 %	50 %	0 %	148259245

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